El contexto que llevó a la creación de ACADI en 2002 fue el resultado de décadas de integración y trabajo conjunto entre las principales asociaciones médicas del aparato digestivo en Colombia. Desde la década del 70 del siglo pasado, asociaciones como la de Gastroenterología, Endoscopia Digestiva y Coloproctología, colaboraban estrechamente en eventos científicos, congresos y jornadas de actualización

A finales de los años 90 y al inicio del 2000, la organización conjunta de numerosos eventos académicos generó la necesidad de contar con una estructura más formal y legal para coordinar actividades, gestionar recursos y cumplir con las nuevas exigencias fiscales, tributarias y administrativas impuestas por el gobierno colombiano. Antes de la creación de ACADI, la Asociación Colombiana de Gastroenterología gestionaba recursos y eventos en nombre de todas las asociaciones, pero esto ya no era suficiente debido al aumento de regulaciones.

Por ello, tras un año de reuniones y planeación, el 2 de septiembre de 2002 se fundó ACADI para formalizar y reglamentar la “unión de hecho” existente, fortalecer la gestión conjunta y cumplir con los requisitos legales y administrativos necesarios para continuar con la educación médica y las actividades científicas de manera organizada y eficiente.